MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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67002	NC_013205	AGC	2	6	2982989	2982994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512868
67003	NC_013205	CGA	2	6	2983011	2983016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512868
67004	NC_013205	GCC	2	6	2983070	2983075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512868
67005	NC_013205	CGGT	2	8	2983134	2983141	0 %	25 %	50 %	25 %	258512868
67006	NC_013205	GTG	2	6	2983229	2983234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512869
67007	NC_013205	CCG	2	6	2983281	2983286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512869
67008	NC_013205	AGC	2	6	2983304	2983309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512869
67009	NC_013205	CACC	2	8	2983398	2983405	25 %	0 %	0 %	75 %	258512869
67010	NC_013205	GGT	2	6	2983452	2983457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512869
67011	NC_013205	CGTACG	2	12	2983464	2983475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258512869
67012	NC_013205	GCG	2	6	2983479	2983484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512869
67013	NC_013205	CGA	2	6	2983494	2983499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512869
67014	NC_013205	GTT	2	6	2983504	2983509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512869
67015	NC_013205	TTG	2	6	2983571	2983576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512869
67016	NC_013205	TCG	2	6	2983604	2983609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512869
67017	NC_013205	TGA	2	6	2983647	2983652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512869
67018	NC_013205	CGT	2	6	2983704	2983709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512869
67019	NC_013205	AGT	2	6	2983743	2983748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512869
67020	NC_013205	GAT	2	6	2983783	2983788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512869
67021	NC_013205	ATC	2	6	2983802	2983807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512869
67022	NC_013205	GTG	2	6	2983817	2983822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512869
67023	NC_013205	TCC	2	6	2983871	2983876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67024	NC_013205	TTC	2	6	2984049	2984054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67025	NC_013205	CCG	2	6	2984306	2984311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512870
67026	NC_013205	GC	3	6	2984365	2984370	0 %	0 %	50 %	50 %	258512870
67027	NC_013205	TCC	2	6	2984384	2984389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512870
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67029	NC_013205	CG	4	8	2984444	2984451	0 %	0 %	50 %	50 %	258512870
67030	NC_013205	GC	3	6	2984511	2984516	0 %	0 %	50 %	50 %	258512870
67031	NC_013205	GC	3	6	2984543	2984548	0 %	0 %	50 %	50 %	258512870
67032	NC_013205	GCG	2	6	2984615	2984620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512870
67033	NC_013205	CTG	2	6	2984707	2984712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512870
67034	NC_013205	TGGAA	2	10	2984777	2984786	40 %	20 %	40 %	0 %	258512871
67035	NC_013205	CGC	2	6	2984838	2984843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512871
67036	NC_013205	CG	4	8	2984853	2984860	0 %	0 %	50 %	50 %	258512871
67037	NC_013205	GTG	2	6	2984869	2984874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512871
67038	NC_013205	CGA	2	6	2984901	2984906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512871
67039	NC_013205	TCA	2	6	2984930	2984935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512871
67040	NC_013205	GGA	2	6	2984961	2984966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258512871
67041	NC_013205	AAT	2	6	2985025	2985030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258512871
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67044	NC_013205	CG	3	6	2985061	2985066	0 %	0 %	50 %	50 %	258512871
67045	NC_013205	GCG	2	6	2985211	2985216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512871
67046	NC_013205	GTC	2	6	2985304	2985309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512871
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67050	NC_013205	CG	3	6	2985538	2985543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67051	NC_013205	CTC	2	6	2985560	2985565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67052	NC_013205	GGC	2	6	2985566	2985571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67053	NC_013205	CGG	2	6	2985601	2985606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67054	NC_013205	GC	3	6	2985614	2985619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67055	NC_013205	GC	3	6	2985653	2985658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67056	NC_013205	AGC	2	6	2985660	2985665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67057	NC_013205	CGC	2	6	2985678	2985683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67058	NC_013205	GC	3	6	2985702	2985707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67059	NC_013205	ACA	2	6	2985781	2985786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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67062	NC_013205	GC	3	6	2985984	2985989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67063	NC_013205	TCTGCC	2	12	2986075	2986086	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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67071	NC_013205	GCCC	2	8	2986378	2986385	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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67074	NC_013205	GCGTC	2	10	2986672	2986681	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67075	NC_013205	GAG	2	6	2986733	2986738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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67082	NC_013205	GTTCC	2	10	2986971	2986980	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67083	NC_013205	GC	4	8	2987003	2987010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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67087	NC_013205	ACAG	2	8	2987176	2987183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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67094	NC_013205	TCCCA	2	10	2987463	2987472	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
67095	NC_013205	GC	3	6	2987477	2987482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67096	NC_013205	CCCAT	2	10	2987632	2987641	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
67097	NC_013205	CCG	2	6	2987719	2987724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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67099	NC_013205	CG	3	6	2987864	2987869	0 %	0 %	50 %	50 %	258512872
67100	NC_013205	GC	3	6	2987870	2987875	0 %	0 %	50 %	50 %	258512872
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67108	NC_013205	ACGCCC	2	12	2988171	2988182	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	258512872
67109	NC_013205	GCC	2	6	2988221	2988226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512872
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67115	NC_013205	GC	3	6	2988445	2988450	0 %	0 %	50 %	50 %	258512872
67116	NC_013205	C	6	6	2988456	2988461	0 %	0 %	0 %	100 %	258512872
67117	NC_013205	GCC	3	9	2988489	2988497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512872
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67119	NC_013205	ACG	2	6	2988582	2988587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512872
67120	NC_013205	GCG	2	6	2988606	2988611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512872
67121	NC_013205	GATGGC	2	12	2988638	2988649	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258512872
67122	NC_013205	CAT	2	6	2988662	2988667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512872
67123	NC_013205	TG	3	6	2988669	2988674	0 %	50 %	50 %	0 %	258512872
67124	NC_013205	CGA	2	6	2988697	2988702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512872
67125	NC_013205	TCG	2	6	2988759	2988764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512872
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67328	NC_013205	CGT	2	6	2997436	2997441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512881
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67331	NC_013205	CG	3	6	2997544	2997549	0 %	0 %	50 %	50 %	258512881
67332	NC_013205	CGC	3	9	2997560	2997568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512881
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67335	NC_013205	CGC	2	6	2997693	2997698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512881
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67338	NC_013205	GGC	2	6	2997772	2997777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512881
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67340	NC_013205	GTTC	2	8	2997826	2997833	0 %	50 %	25 %	25 %	258512881
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67348	NC_013205	GCT	2	6	2998071	2998076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512882
67349	NC_013205	CG	3	6	2998125	2998130	0 %	0 %	50 %	50 %	258512882
67350	NC_013205	CTG	2	6	2998168	2998173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512882
67351	NC_013205	CCG	2	6	2998192	2998197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512882
67352	NC_013205	GTC	2	6	2998303	2998308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512882
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67473	NC_013205	GGCCT	2	10	3003761	3003770	0 %	20 %	40 %	40 %	258512891
67474	NC_013205	CGC	2	6	3003771	3003776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512891
67475	NC_013205	GGC	2	6	3003779	3003784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512891
67476	NC_013205	TGG	2	6	3003822	3003827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512891
67477	NC_013205	GCA	2	6	3003867	3003872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512891
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67479	NC_013205	TGC	2	6	3003987	3003992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512891
67480	NC_013205	CGG	2	6	3004015	3004020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512891
67481	NC_013205	GCA	2	6	3004056	3004061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512891
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67484	NC_013205	C	6	6	3004148	3004153	0 %	0 %	0 %	100 %	258512891
67485	NC_013205	ATGCCG	2	12	3004232	3004243	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258512891
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67488	NC_013205	TCG	2	6	3004331	3004336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512891
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67492	NC_013205	CCGT	2	8	3004457	3004464	0 %	25 %	25 %	50 %	258512891
67493	NC_013205	GC	3	6	3004493	3004498	0 %	0 %	50 %	50 %	258512891
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67499	NC_013205	GTA	2	6	3004798	3004803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512891
67500	NC_013205	CCG	2	6	3004840	3004845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512891

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